Une fois créées, les ressources et autres contenus pédagogiques doivent être organisés. Il est possible de les déposer tels quels sur une plate-forme, mais il est aussi intéressant de les organiser via des chaînes éditoriales (Scenari par exemple) ou à l'aide de logiciels auteurs (comme Articulate). Un parcours sera alors conçu, en offrant à l'étudiant la possibilité de suivre un chemin guidé ou libre. Ces parcours forment ainsi des ensembles clairement identifiables composés de différentes briques d'apprentissage (briques qui peuvent être réutilisées ailleurs selon les dispositifs choisis).